大乘佛教认为佛身有三种，即法身、报身、应身。“身”是“积集”的意思，但这里的身不仅指肉身，还表示理性和智慧。
法身，是佛教真理之身。法身又分自性清净法身和离垢妙极法身两种。自性清净法身就是真如。真如对有情来说叫佛性，对无情来说叫法性。佛教认为一切有情无情体皆真如。佛经常言，“一切有情，皆有佛性”，“山河大地尽皆真如”，正说明了这个道理。离垢妙极法身是指佛在因地之中，勤修福德与智慧，断烦恼、证菩提而成就的清净之身。
报身，梵语称“卢舍那佛”，汉译为“净满”，即一切妄想彻底断除，智慧究竟圆满之意，是真、善、美的高尚理境和无我纯洁的精神果报。报身也有两种，即自受用报身和他受用报身。自受用报身就是以法身为因，经过累劫的修行而证得的圆满无上菩提之身，也就是唯识宗所称之根本智。此智体性寂然，不起任何分别。佛持此智住于真境，享受法乐。释迦牟尼佛在菩提树下证果后，七日不起法座，思维法乐，就是显现的具备根本智的报身。他受用身是为十地菩萨显现的庄严报身。“如来现起他受用，十地菩萨所被机。”十地菩萨根机深，智慧大，能见佛闻法，所以佛现报身，以让十地菩萨受用。
应身，即应物现身，指佛为普度三界六道不同根机的众生所现之身，为随类化现之功德身。化身也有两种：示身化身和应生化身。示身化身就是方便示现的“生身”(生理)佛身。二千年前，释迦佛为实施权，以“八相”成道，示现的佛身就是示身化身。应身化身指随类化现之身，有胜应身和劣应身两种。佛为地上菩萨说圆顿大教《华严经》，示现千丈卢舍那佛身，这是胜应身；为鹿野苑五比丘三转四谛法轮，现老比丘相，这是劣应身。
三身佛也是供于佛寺主殿，中央为法身佛，左为报身佛，右为应身佛。三身佛形貌一致，只以手印不同而相互区别。法身佛结法界定印，两手仰掌相叠，右手在上，左手在下，两手大拇指向上相触。报身佛结与愿印，左手安置于膝上，右手仰掌垂下。应身佛就是释迦牟尼成道的姿势。如北京广济寺的大雄宝殿中供奉的便是三身佛。
三身佛中，卢舍那佛有时单独供奉在大雄宝殿或毗卢阁中，结跏趺坐，左手安放膝上，右手结施愿印。佛座为千叶莲座，每一莲瓣上有一尊小佛，那是应身释迦佛。这是根据《梵网经》所说“我今卢舍那，方坐莲花台，周匝千花上，复现千释迦，一花百亿国，一国一释迦，各坐菩提树，一时成佛道”的内容而塑造的。每一莲瓣表现一百亿国土的光景，而成三千大千世界的大观。