明万历三大征后，国库空虚。神宗派宦官为矿监税使，往各地监督开矿，到处征税，激起城镇商人、业主、工匠、生员及御史言官、州县长吏、乡绅等反抗，即民变。最具代表性者有：(1)临清民变。临清地处山东卫河、运河咽喉，商货云集。太监马堂以天津税监兼辖临清，对杂粮十石以下及小本生意亦行抽税，弄得中产破家，远近罢市。万历二十七年(1599)，贩者王朝佐率脚夫小民三四千人，围马堂税监衙门，州民随者万数。马堂不敢出见，令爪牙放箭，激起公愤，民烧其署衙，杀爪牙三十余人，合城罢市。神宗下诏捕“首恶”，株连甚众。朝佐挺身入狱，临刑神色不变。(2)武昌民变。万历二十七年(1599)，太监陈奉至湖广武昌、汉阳，兼管征税、采矿、铸钱。他百般搜刮，乡官、富户、商贾、贫民等皆不能免，士民恨入骨髓，民变不断。二十九年，湖广佥事冯应京疏列陈奉十大罪，反被朝廷逮问。武昌数万市民愤起，包围陈奉官署。陈奉惧匿楚王府，逾月不敢出。爪牙十六人被市民投入长江。湖广通省怨奉，众怒不可遏，神宗无奈，只得撤回陈奉。(3)苏州民变。苏州为江南商业、纺织业中心。苏杭织造太监孙隆于苏城各门立税，只鸡束菜亦不能免。又对地方机户牙行广派税额，每机一张税银三钱。机户皆罢织抗议，机工生活无着。万历二十九年(1601)六月六日，葛成(一作葛贤)领导二千多机工聚集元妙观誓神，然后分六队，极有秩序逼近孙隆衙门。隆乘夜急避杭州。民众击毙其爪牙黄建节等数人，焚烧税棍汤萃等数家，但不取官府、百姓家一物。事变第五日，官府追捕，葛成挺身下狱，慰劳者不绝。四十一年，成得释出狱。(4)福州民变。万历二十七年(1599)，太监高寀监税福建。此后，他胁挟官府，虐害百姓，勒索商贾。擅取民间货物大至金银，小至米粮，无一付酬，商贩叫苦不迭。四十二年各铺行匠作等往其衙讨欠钱，高宋反令爪牙行凶，激起民愤。万众不谋而合，围其衙，杀爪牙多人。整整三日，全城如沸如煎。神宗得知，召寀还京。